一、加工业污染治理
随着我国农村种植业、养殖业的发展，各种水果、肉食品等加工厂如雨后春笋般涌现，由于布局分散、工艺落后、经营粗放、生产量大，各种废水未经处理直接排放到河流、水库、堰塘和农田中，污染了环境。同时，大量的加工固体废物对地表水和地下水产生了二次污染，而在农村有限的条件下，确实无法对固体废物进行有效处理，严重污染了当地水环境。
治理措施：①加强农村环境保护宣传教育工作，做到家喻户晓，人人皆知。②农村种养大户和水果、肉食品加工单位带头控制污水的排放量，引导和带动当地农民控制污水排放量。③加强加工业建设，统筹规划、合理布局，大力推广清洁生产技术。④鼓励水果、肉食品加工厂向城镇工业园区集中，实行污水、垃圾集中控制、集中处理。⑤加大资金投入，因地制宜办好污水处理厂，减少加工业污水对农村水环境的污染。
二、生活垃圾、污水污染治理
我国新农村建设大部分选择在沿河地段，人多而集中。由于农民的环境保护意识不强，生活环境“脏、乱、差”现象突出。村民生活垃圾沿河边到处都是，下雨渗透垃圾物后，污水流入河中；生活污水乱倒，流入河中；农村没有垃圾处理厂和污水处理厂，加大了河水的污染程度。
治理措施：①各村新建一个垃圾集中放置池，每户发放一个垃圾桶。②各村成立一个环保队，安排环保人员每隔1～2天挨家挨户清理垃圾桶中的垃圾，并运往垃圾放置池进行统一处理。③在各村安装排污管，将污水送到污水处理厂，通过处理达标后再排放到河中。④修建藻类塘处理系统，即通过管网将污水送到藻塘内，利用藻类产生的氧气，对污水中的污染物进行有效去除。
三、畜禽养殖污染治理
调查统计表明：饲养1头牛产生的污水相当于22个人生活产生的污水，饲养1头猪产生的污水相当于7个人生活产生的污水。我国绝大数畜禽养殖场建设在农村，其污水排放量大，对农村水环境造成严重污染。
治理措施：①在水源地配置警示牌，严禁往河流、堰塘、水库中丢弃死畜禽，违者按《中华人民共和国水污染防治法》中的有关规定给予处罚。②尽快使流域内的散养户向规模化、集约化发展，建设标准的畜禽养殖区。③在“远离河道，规模养殖，严控污染”的原则下，对上游地区的畜禽养殖场实施规范化管理。④发展生态循环养殖模式，使畜禽粪便减量化、无害化、资源化。以猪场为例，采用“猪—沼—菜”工艺模式，将猪场的粪尿引入沼气池，沼气用于发电，沼液、沼渣施于农田。
四、化肥、农药污染治理
随着我国种植业不断发展，化学肥料和化学农药的使用量居高不下，严重污染了农业土壤和水环境。化肥是农作物生长需要的重要养料，在我国实际利用率只有40%左右，大量化肥随水体流入堰塘、水库、湖泊、河流，造成水体面源污染；农药是防治农作物病虫害的重要物质，一般农药只有15%左右附着在农作物上，其余部分流失在土壤、水体、空气中，造成农业污染。
治理措施：①大力发展设施农业，推广秸秆粉碎还田技术。②积极推广农田稻-鸭、稻-鳅等种养技术，减少化肥和农药的使用量。③广泛运用物理和生物技术防治病虫害，减少农作物农药残留数量。④通过水旱轮作、豆科与禾本科轮作、用地与养地相结合的生态种植模式来提高农田效益。⑤建立慢速渗滤或快速渗滤土壤处理系统，通过过滤、吸附、土壤微生物的降解作用，使污水得到净化。⑥实行测土配方施肥，通过测土、配方、配肥、施肥，增加有机复合肥和生物肥料的使用。⑦大力发展“一池三改”用户沼气，将人畜粪便资源化处理，广泛使用沼液、沼渣有机肥料，减少化肥用量和污染源。⑧加快耕地农牧、果牧的结合应用，推广畜禽—沼气—作物、畜禽—沼气—果树、果园养禽、林地养畜等种养模式，实现生态种养，减少农业面源污染。
五、矿山污染治理
矿山污染主要来源于矿山开发中使用的化学药品和矿山本身存在的化学元素。矿山开发中的化学药品长期残存于废弃矿山的土壤与水体中，通过土壤或岩石的缝隙及雨水进行扩散，对周围雨水流经下游地区造成严重的水环境污染。矿山开发后对矿山表层植被、覆盖的岩层与土壤产生破坏，固体废物增多，导致矿山本身存在的化学元素与雨水、空气等发生化学反应，产生对人体及环境有害的物质。
治理措施：①严格落实矿山企业固体废物的综合利用和安全处置措施。②向被污染的矿山中加入化学氧化剂，改变污染物的化学结构，使污染物降解或转化为毒性弱、移动慢的化学成分；或利用还原剂与污染物发生还原反应，改变污染物化学结构，从而消除毒性。③及时恢复开采矿山破坏的植被，通过植物去除、吸收、降低水体与土壤中的污染。
