报告和综合信息收集整理、甲肝疫苗强化免疫、媒介生物密度检测和控制、现场防疫、水和食品卫生理化检验等方面展开工作，帮助当地疾控中心初步恢复常规防疫工作秩序。同时，卢金星还整合各方疾控力量，以国家疾控中心应急检验车为主体，建立了“汶川县公共卫生应急检测实验室”，并利用该实验室开展了城区和乡镇集中供水点的卫生学和理化指标检测、临床病原学检测、饮食卫生检测等工作。此外，他还与队员连续工作三天三夜开发出“汶川县公共卫生检测实验信息系统”，为实验检测数据的统计、分析、利用提供了极大方便。一个多月的艰苦奋战，卢金星和他的队伍不仅对当地“大灾之后无大疫”作出了贡献，同时也积累了丰富的救灾防病经验，为国家救灾应急能力建设提供了参考。
2010年，玉树地震发生后，卢金星又一次作为疾控中心的中坚力量赶赴灾区一线。玉树是旱獭型鼠疫源地，地震发生后，确保灾区人民、救灾人员、灾后重建人员不得鼠疫是防疫工作的重中之重。有了汶川地震的救灾防疫经验，卢金星还在玉树的救灾防疫工作得心应手。在完成常规任务的同时，他在当地建立了鼠疫监测基地，主动监控动物间鼠疫流行情况，实时采取有效措施，从而保证无论是救灾应急阶段，还是恢复重建时期，都能够对当地的鼠疫防控提供有力的技术保障。而中国疾控中心传染病预防控制研究所，则因在抗震救灾中的突出表现，被党中央、国务院、中央军委授予“抗震救灾英雄集体”荣誉称号。
“舟曲特大泥石流的灾后情况同地震不完全一样，我们去了之后做的第一件事是常见传染病风险评估，包括调查当地历史上的常见传染病，评估当下发生传染病的几率，监测与传染病发生、发展有关的要素，特别是环境问题等。”卢金星作为卫生部专家组组长率队现场考察、调研，对积水中蚊幼监测和控制、生活饮用水供应和卫生学指标监测、高腐尸体卫生防疫处理、传染病监测、环境卫生保障、灾民临时安置点卫生、过渡期疾控和监督用房等提出了一系列建议，被救灾指挥部一一采纳并付诸实施，取得了良好的效果，为灾区防病工作发挥了关键作用。为此，卢金星荣获“全国防汛抗旱先进个人”光荣称号。
卢金星平静诉说着经历过的种种，仿佛在讲述别人的故事。他说，“疾控中心作为一支专业的疾病防疫队伍，在平时的科研和实践过程中积累了丰富的经验。养兵千日，用兵一时。国家和人民有难的时候，冲到第一线是我们的天职。”
“我们的职业要求我们这样做，受灾的群众也需要我们这样做。”
“一旦到了现场，开始做了，就必须科学有序、扎扎实实，从最基础的东西开始做起。”卢金星在汶川停留一个多月，在玉树更是待了整整45天，“刚好把我该干的事情做好了，除了硬件做好了，管理上也规矩了，基础打好以后，谁来都能很快接手。”
让卢金星欣慰的是灾难过后社会的进步和意识的提升。1998年洪涝后，人们加深了对生态环境的认识，从而采取一系列措施改善我国生态环境；SARS的爆发流行对政府应对突发性公共事件的能力提出了严峻考验，推动了我国突发卫生事件应急条例的出台和疫情监测直报网络系统的建立；地震、特大泥石流等重大灾难的发生，则为我国的救灾、防灾、应急机制敲响了警钟，加快了国家疾病防御控制体系的不断完善，以及各种硬件设施、能力平台的建设。而经历了各种重大事件和心理磨练的人民群众，也能够对生命、对大自然有了更客观、深刻的认识，能够对各种风险有正确的认知，并做到科学的防范，在下一场未知灾难来临时，主动有序地应变。
正是因为有了国家综合实力的提升，有了政府对救灾防疫的重视与支持，有了以卢金星为代表的疾控卫士们专业科学的工作、忘我拼搏的付出，才保障了灾区人民和救灾人员的健康，维护了灾区环境的安全，也打破了“大灾之后必有大疫”的传统说法，形成了中国特色的应急救灾防疫保障体系。
另一方面，疾控人员在现场的经历也成为宝贵的财富和资源，传染病预防控制所特别设立的“传染病控制案例教学”课程就充分利用了这些资源。“这个课程涉及到传染病预防控制的整个流程。从现场的流行病学调查、现场疫情处理、样本采集，到实验室检测数据的应用，及后期的病原分子生物学研究、致病机理研究以及同类疾病的对比研究，从宏观到微观，逐层剖析。从实践上升到理论，然后再指导实践。每一位老师都是各个案例的亲历者，以自己的亲身感受生动讲解，同时也在教授的过程中吸收新的给养，从而不断提高。”
卢金星认为，现阶段的疾控队伍真正缺少的是实用型、技术型人才。我们应该在基础理论研究打好根基的同时，从实际出发，切实了解国家疾控工作的缺口，迎合需求去展开研究、培养人才。“既保证前瞻性的研究和人才培养，又保障实际应用人才的后续支持。”
人们能够感受到灾难、疾病的突如其来与逐渐消失，却少有人了解这些过程中疾控卫士们所承担的风险，更少有人看到他们严谨专业的工作态度与无私奉献的拼搏精神。他们没有口号式的宣传语，没有镁光灯的频频闪烁，有的只是在国家和人民需要时奋不顾身的投入。老一辈疾控研究者淡然忘我的职业操守和默默付出的工作态度，也传承到新一代疾控人员的心中，指引着他们不断向前。
